化學藥液過濾(chemical filter)，雖然也掛著過濾器，但顧名思義，它和潔淨室里到處可見的微塵過濾器(particulate filter)不同，它不是用以處理微塵顆粒，它是用以處理和分子等級有關的」氣體」。
氣體無法像微塵那樣，用攔截或類似過篩的方式處理。微塵過濾器所用的濾布，對這些氣體而言，都算太大了。因此，如果真要處理這些氣體，就有必要使用另外的方式，或許這些方式有些偏向化學，故名化學過濾器。
也因為如此，潔淨室里的潔淨度，由微塵過濾器負責處理可數的微塵顆粒，而潔淨室里的某些氣體，則由化學過濾器處理，其結果，就是有雙層不同用途的過濾器。
早期，化學過濾器幾乎只有半導體廠在使用。雖然面板產里的曝光機有安裝化學過濾器，但坦白說，過去也很少有更換的意識，曝光機的化學過濾器需更換，也是發現透鏡霧化(Lens Haze)後，才有的想法。
一、泡棉式
濾棉是最基本的使用率最高的過濾材料，不管是哪種的過濾器，基本都是必不可少的，主要的就是過濾掉水中魚的排泄物等大量的廢物，將他們從魚缸中過濾出來，也讓他後面的濾材發揮作用。濾棉主要是物理過濾的功能，雖然也能存在一些硝化細菌，但數量有限，而且還要經常的清洗，所以生化過濾的功能基本沒有了。
濾棉要選購通水性好，不易損壞的，而且不易掉落，不掉色，不會對水質造成二次污染的，平時要多注意維護，經常檢查水流量，避免異物過度造成堵塞，清洗的時候最好用缸里的水，或者用自來水清洗，不要放洗滌劑之類的清潔劑，濾棉有一定的使用壽命，根據自己的使用情況定期的更換。
二、生化棉
是使用最普便的一種濾材，具良好的滲透性。是一種合成材料，呈絲狀柔軟，作為過濾床的外(上)層鋪設材料，它對水中的懸浮物具有良好的吸附能力，並能蘊藏大量的耗氧生化菌。水流經濾材可以濾除水中絮凝的大顆粒雜質，提高水的透明度，其粗糙且佈滿小孔隙的表面，可吸附大量硝化細菌，並供其生長繁殖，以分解水中氨、亞硝酸鹽等有機物，可同時具備物理和生物過濾兩種功能。
當濾棉表面雜質污物積累過多時，稍稍清洗即可繼續使用。過濾棉纖維較穩定，長期使用也不會互相粘合和縮小而變形，較其它濾材既不易腐爛又耐用，但為了不影響過濾效果，使用到一定程度也需要更換。過濾棉可以用作過濾介質的第一層，也可用作最後一層，大多數情況下置於起始層以濾除大部分較粗的髒顆粒，使下層過濾介質不致於太髒，從而提高過濾效果。在過濾器中，過濾棉安放厚度要適中，既不能影響水流通過，又要獲得良好的過濾效果。
很多人都認為它的作用很大而喜歡使用。它密度較低，較硬，不易變形，主要用作消音(滴漏)，隔泡之用，亦有養菌的功能，但因其表面積小，養菌數量遠不及玻璃環。在我們本來就有限的過濾空間裏，它實在不是什麼好選擇 。常見的以黑色和藍色為主，功能上無分別。
活性炭過濾器用途
廣泛適用於食品、醫藥、電子、化工、工業廢水等行業。
活性炭過濾器作用
活性炭過濾器的作用主要是去除大分子有機物、鐵氧化物、余氯。這是因為有機物、余氯、鐵氧化物易使離子交換樹脂中毒，而余氯、陽離子表面活性劑等不但會使樹脂中毒，還會破壞膜結構，使反滲透膜失效。
活性炭過濾器的特性
1、效率高：24小時連續工作，不需停機反衝洗。
2、運行費用低：不需高揚程大流量的反衝洗泵。
3、維護費用低：其在運行過程中除石英砂濾料外沒有任何轉動部件，故障率低，維護費用省。
4、一次性投資低：不需單設混凝池、澄清池等設施，不需反衝洗泵和電動、氣動閥門等設備，工程量小，一次性投資省。
5、水頭損失小：單一濾料且濾料清潔及時，水頭損失小，總水頭損失≤0.5m。
6、進水水質要求寬鬆：可長期承受150mg/L濃度SS進水水質，短時承受300mg/L濃度SS衝擊而出水水質不變。
7、出水水質穩定、過濾效果好。濾料清潔及時，可保證高質、穩定的出水效果，無周期性水質波動現象。
8、易於改擴建：所採用的單元操作方式可根據水量變化靈活增加或刪減過濾器數量，易於改擴建。
9、佔地面積小，外形美觀：其將傳統的三段式再生水處理工藝為一體，節省用地約70-80%;外觀更美觀、緊湊。
活性炭過濾器工作原理
活性炭的吸附原理是：在其顆粒表面形成一層平衡的表面濃度，再把有機物質雜質吸附到活性炭顆粒內，使用初期的吸附效果很高。但時間一長，活性炭的吸附能力會不同程度地減弱，吸附效果也隨之下降。如果水族箱中水質混濁，水中有機物含量高，活性炭很快就會喪失過濾功能。所以，活性炭應定期清洗或更換。